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首先先取一個潔凈與干燥的計數板的一個桌面上，再用一個干凈的蓋玻片在計數室上，用以一個無菌的細口的一個滴管取一些均勻的菌液的蓋玻片上，用于計數室內的 一個滲透。
顯微鏡的計數，在我們了解計數板靜止狀態時，先在顯微鏡的一個低倍鏡下觀察找到了計數室，然后再用高倍鏡進行計數，一般都以每個小格有五到十個菌體為適宜的。基菌液的密度相對太高，需要先進行稀釋。
在清洗計數板時，是需要取下蓋玻片的，用自來水進行沖洗，不能用硬物來洗刷，以免能讓計數室網格上損壞。需要計數室的體積的一個影響。洗完后需要吹干的。
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