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數碼生物顯微鏡是主要以攝像頭作為主要元件的顯微鏡，在實像面處顯微鏡的攝像頭，一般我們在與普通顯微鏡作比較： 1）具有三維顯示功能，可以深度合成就可。 2）可以對其鏡頭進行變焦就可以更方便調整放大倍數。 3）不能對我們觀察對象進行分解與切割以及加工這些處理。 4）方便我們進行任何角度以便觀察。 5）不需要將設置時間來作完整照明系統。 6）方便直接將圖像來作存儲。 7）方便多人作圖像的觀察，
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